Blood Advanced Direct PCR Kit (With Dye);血液直扩PCR试剂盒(含染料)

产品简介

本品是一款可直接对全血样本进行PCR扩增而无需进行DNA纯化或样本预处理的试剂盒,兼容含EDTA、肝素、柠檬酸盐等常规抗凝剂的新鲜血液、冷藏(冻)血液及Whatman903®FTA®商用干血渍。试剂盒中含有经过经基因工程改造的DNA Polymerase组合,具有保真性高、对PCR抑制剂耐受性强的特点,2× Blood Direct PCR Buffer中添加强力延伸因子、扩增增强因子以及优化的缓冲体系,能够在快速延伸条件下高效扩增8 kb的基因组片段,对于2 kb以下的片段,设置3-5 sec/kb延伸时间即可完成扩增,从而大幅缩短血液样本的鉴定及检测时间。

本试剂盒的扩增产物的3’端为平末端,适用于一步法快速克隆及TOPO克隆试剂盒(Arcegen CAT# N132081)。试剂盒中提供的引物预混液Positive control primer mix (10 μM each)能够从哺乳动物和大多数脊椎动物的sox21基因上游保守序列中扩增出长度237 bp的片段,可作为阳性对照使用。

产品规格 

产品货号

N132022E

N132022S

产品规格

50 T

100 T

组分信息

组分编号

组分名称

N132022E

50 T

N132022S

200 T

N132022-A

2× Blood Direct PCR Buffer

1.25 mL

2.5 mL

N132022-B

Advanced High-Fidelity DNA Polymerase Mix

50 μL

100 μL

N132022-C

Positive control primer mix (10 μM each)

100 μL

200 μL

N132022-D

10× DNA loading buffer

1 mL

1 mL

产品储存

-25~-15℃保存,有效期1年。

适用范围

不同类型的全血样本直接PCR反应。

操作注意

1)推荐血液模板使用量为反应总体积的10%,即50 μL反应体系中加入5 μL全血作为模板,注意避免吸取血液凝块。

2)延伸时间10 sec/kb可扩增8 kb以下大部分目的片段,3-5 sec/kb即可扩增大部分2 kb以下片段。若扩增效率较低,可适当延长时间至30 sec/kb

3)PCR反应结束后,推荐将反应产物于4000 rpm (1000× g) 离心1-3 min以沉淀血细胞碎片,取上清进行下游分析。

4)本产品不可直接用于医疗诊断。

5)为了您的安全和健康,请穿实验服并佩戴一次性手套操作。

操作说明

PCR反应体系

1. PCR反应体系

组分

体积(μL

2×Blood Advanced PCR Buffer

25 μL

Advanced High-Fidelity DNA Polymerase Mix

1 μL

Forward Primer (10 μM) b

2 μL

Reverse Primer (10 μM) b

2 μL

血液样本c

X

ddH2O

to 50 μL

【注】:各组分使用前应充分混匀。

a. 使用前请充分混匀各组分。

b. 推荐每条引物的使用终浓度为0.4 μM,过高会导致非特异性扩增。

c. 最佳全血模板浓度范围为0.5%-20%,推荐使用量为10%作为初始尝试条件,即50 μL反应体系中加入5 μL全血作为模板,注意避免吸取血液凝块。对于贮存在Whatman®滤纸卡上的干血渍,则可取约1 mm2带血渍的圆纸片,无需进行预处理,直接放入PCR反应液中即可进行扩增。

PCR反应条件

2 PCR反应程序

循环步骤

温度

时间

循环数

预变性

95

5 min

1

变性

95

15 sec

30-35

退火*

60

15 sec

延伸**

72

3-10 sec/kb

终延伸

72

5 min

1

Note】:

1) *退火温度为通用Tm值或低于引物Tm1-2℃。如果扩增产物特异性较差,可以建立退火温度梯度以寻找最佳退火条件。

2) **延伸时间10 sec/kb可扩增8 kb以下大部分目的片段,3-5 sec/kb即可扩增大部分2 kb以下片段。若扩增效率较低,可适当延长时间至20-30 sec/kb,不应超过60 sec/kb

PCR产物分析

PCR反应结束后,推荐将反应产物于4000 rpm (1000× g) 离心1-3 min以沉淀血细胞碎片,取上清进行下游分析。该步骤可消除全血中多种残留成分对电泳检测的干扰,对使用高浓度血液作为模板的PCR产物尤为必要。通常,5 μL/50 μL (10%)反应产物可取30-35 μL上清,3 μL/50 μL (5%)反应产物可取40-45 μL上清。若需对PCR产物进行其它分析,例如酶切等,应将产物稀释2-4倍以降低反应中的盐及其它抑制剂对反应的干扰。

对照反应

试剂盒内提供引物预混液Positive Control Primer Mix (10 μM each) 用于阳性对照反应。可从哺乳动物及其他许多脊椎动物的基因组sox 21基因上游序列中扩增出237 bp的片段,该扩增区是一段高度保守的非编码区。

Primer F: 5'- AGCCCTTGGGGASTTGAATTGCTG -3'   

Primer R: 5'- GCACTCCAGAGGACAGCRGTGTCAATA -3'

常见问题与解决方案

无扩增产物或产量少

产物呈现高分子量弥散条带

产物呈现低分子量弥散条带

检查引物设计,确认引物浓度和纯度

提高退火温度或设置退火梯度

电泳前离心取上清

重复实验,确认体系、程序无误

延伸时间不应过长

提高退火温度或设置退火梯度

增加循环数

尝试不同的血液用量

尝试不同的血液用量

优化退火温度

减少循环数

减少循环数

尝试不同的血液用量

降低引物浓度

降低引物浓度

重新设计引物

 

重新设计引物

 

 

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