产品简介
2×Universal qPCR Fluore Green Master Mix (No ROX adjustment)是2×实时定量PCR扩增的预溶液,高灵敏度、高特异性,颜色为蓝色,具有加样示踪的作用。核心组分Taq DNA聚合酶采用抗体法热启动,可以有效抑制样品准备过程中引物退火导致的非特异性扩增;同时添加了提升PCR反应扩增效率因子和均衡不同GC含量(30~70%)基因扩增的促进因子,可以在较为宽泛的定量区域内获得良好线性关系。
本产品中含有特殊的ROX Passive Reference Dye,适用于所有qPCR仪器,无需根据不同仪器调整ROX。
产品信息
货号 |
N132031E |
N132031S |
N132031M |
N132031L |
规格 |
50 T(20 μL/rxn) |
250 T(20 μL/rxn) |
2500 T(20 μL/rxn) |
5000 T(20 μL/rxn) |
储存条件
冰袋运输。-20℃避光储存,有效期18个月。
本品避免反复冻融。产品中含有荧光染料SYBR Green I,保存或配制反应体系时需避免强光照射。
注意事项
1. 推荐使用Arcegen一链cDNA合成反转录预混液(Cat#N132061),有效去除RNA样品的残留基因。
2. 解冻后Master Mix可能出现絮状或白色沉淀,手握缓慢溶解并上下轻柔颠倒混匀至溶液澄清,不影响试剂性能。
3. 为了您的安全和健康,请穿实验服并佩戴一次性手套操作。
4. 本产品仅用于科研。
使用说明
1. 反应体系
组分 |
体积(μL) |
体积(μL) |
终浓度 |
2×qPCR Master Mix |
25 |
10 |
1× |
Forward Primer (10 μM) |
1 |
0.4 |
0.2 μM |
Reverse Primer (10 μM) |
1 |
0.4 |
0.2 μM |
模板DNA |
X |
X |
- |
无菌超纯水 |
to 50 |
to 20 |
- |
【注】使用前务必充分混匀,避免剧烈震荡产生过多气泡。
1) 引物浓度:通常引物终浓度为0.2 μM,也可以根据情况在0.1-1.0 μM之间进行调整。
2) 模板浓度:如模板为未稀释cDNA原液,使用体积不应超过qPCR反应总体积的1/10。
3) 模板稀释:cDNA原液建议5-10倍稀释,最佳模板加入量以扩增得到的Ct值在20-30个循环为好。
4) 反应体系:推荐使用20 μL或50 μL,以保证目的基因扩增的有效性和重复性。
5) 体系配制:请于超净工作台内配制,并使用无核酸酶残留的枪头、反应管;推荐使用带滤芯的枪头。避免交叉污染和气溶胶污染。
标准程序
循环步骤 |
温度 |
时间 |
循环数 |
预变性 |
95℃ |
2 min |
1 |
变性 |
95℃ |
10 sec |
40 |
退火/延伸 |
60℃ |
30 sec★ |
|
熔解曲线阶段 |
仪器默认设置 |
1 |
快速程序
循环步骤 |
温度 |
时间 |
循环数 |
预变性 |
95℃ |
30 sec |
1 |
变性 |
95℃ |
3 sec |
40 |
退火/延伸 |
60℃ |
20 sec★ |
|
熔解曲线阶段 |
仪器默认设置 |
1 |
【注】快速程序适用于绝大多数基因,个别复杂二级结构基因可尝试标准程序。
1) 退火温度和时间:请根据引物和目的基因的长度进行调整。
2) 荧光信号采集(★):请勿忘记打开荧光信号采集,按照仪器使用说明书要求进行实验程序设置,几种常见仪器的时间设定如下:
20 sec:Applied Biosystems 7700, 7900HT, 7500 Fast
31 sec:Applied Biosystems 7300
32 sec:Applied Biosystems 7500
3) 熔解曲线:通常情况下可以使用仪器默认程序。
2. 结果分析
定量实验至少需要三个生物学重复。反应结束后需要确认扩增曲线及熔解曲线。
1) 扩增曲线:标准扩增曲线为S型。
Ct值落在20-30之间时,定量分析最准确。
Ct值小于10,需要将稀释模板后,重新进行实验。
Ct值介于30-35之间时,需要提高模板浓度,或者增大反应体系的体积,以提高扩增效率,保证结果分析的准确性。
Ct值大于35时,检测结果无法定量分析基因的表达量,但可用于定性分析。
2) 熔解曲线:
熔解曲线单峰,表明反应特异性好可以进行定量结果分析;若熔解曲线出现双峰或者多峰,则不能进行定量分析。
熔解曲线出现双峰,需要通过DNA琼脂糖凝胶电泳判断非目标峰是引物二聚体还是非特异性扩增。
如果是引物二聚体,建议降低引物浓度,或者重新设计扩增效率高的引物。
如果是非特异性扩增,请提高退火温度,或者重新设计更高特异性的引物。
3. 引物设计指南
1) 推荐引物长度25 bp左右。扩增产物长度150 bp为佳,可以在100 bp-300 bp内选择。
2) 正向引物和反向引物的Tm值相差不宜超过2℃。引物Tm值60℃-65℃为佳。
3) 引物碱基分布要均匀,避免出现连续的4个相同碱基,GC含量控制在50%左右。3’端最后一个碱基最好为G或C。
4) 引物内部或者正反两条引物间最好避免出现有3个碱基以上的互补序列。
5) 引物特异性需要用NCBI BLAST程序进行核对。避免引物3’端有2个碱基以上的非特异性互补。
6) 设计完成的引物需要进行扩增效率的检测,只有具备相同扩增效率的引物才可用于定量比较分析。
4. 适用机型
ABI: 5700, 7000, 7300, 7700, 7900HT Fast, StepOne, StepOne Plus; 7500, 7500 Fast, ViiA7, QuantStudio 3 and 5, QuantStudio 6,7,12k Flex;
Stratagene: MX3000P, MX3005P, MX4000P;
Bio-Rad: CFX96, CFX384, iCycler iQ, iQ5, MyiQ, MiniOpticon, Opticon, Opticon 2, Chromo4;
Eppendorf: Mastercycler ep realplex, realplex 2 s;
Qiagen: Corbett Rotor-Gene Q, Rotor-Gene 3000, Rotor-Gene 6000;
Roche Applied Science: LightCycler 480, LightCycler 2.0; Lightcycler 96;
Thermo Scientific: PikoReal Cycler;
Cepheid: SmartCycler; Illumina: Eco qPCR.
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