产品简介
1st Strand cDNA Synthesis Kit(for PCR/qPCR)是含有gDNA去除步骤的cDNA第一链合成试剂盒。其中的酶,合成cDNA速度快,热稳定性高,可耐受最高60℃的反应温度,适合具有复杂二级结构的RNA模板的逆转录;同时,该酶增强了与模板的亲和力,适合少量模板以及低拷贝基因的反转录;最长可合成长达19.8 kb的cDNA。
本试剂盒包含gDNA digester Mix,可去除RNA模板中残留的gDNA污染;提供两种cDNA合成引物,Random Primers N6和Oligo (dT)18,用户可按需选择,或使用Gene Specific Primers作为引物。试剂盒合成的单链cDNA可直接用来进行后续PCR或者qPCR反应。
产品信息
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货号 |
N132065E |
N132065S |
|
规格 |
10 T |
100 T |
组分信息
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组分编号 |
组分名称 |
N132034E |
N132034S |
|
N132065-A |
RNase-free H2O |
1 mL |
2×1 mL |
|
N132065-B |
5×DNA digester Mix |
30 μL |
300 μL |
|
N132065-C |
10×Super Buffer* |
20 μL |
200 μL |
|
N132065-D |
RT Enzyme Mix** |
10 μL |
100 μL |
|
N132065-E |
Random Primers N6 (50 μM) |
10 μL |
100 μL |
|
N132065-F |
Oligo (dT)18 (50 μM) |
10 μL |
100 μL |
*10×Super Buffer包含gDNA digester抑制剂和dNTPs。
**RT Enzyme Mix包含RNase inhibitor。
储存条件
-25~-15℃避光储存,有效期18个月。
注意事项
1,反应液的配制应在冰上操作完成,操作过程应避免RNase污染。
2,建议RNA溶于水而不是TE中,因为TE会干扰gDNA去除以及逆转录反应。
3,5×gDNA digester Mix、10×Super Buffer、RT Enzyme Mix使用前请轻轻上下颠倒混匀,并小心离心至底部。吸取液体时请使用量程合适的移液器,枪头不要插入液面下过深。
4,qPCR 实验推荐基因组去除步骤,保证结果更加真实可靠。
5,为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
6,本产品仅用于科研。
使用说明
1,关于逆转录引物的选择
1)如果模板为真核生物来源,建议选择Oligo (dT)18,与真核生物mRNA的3’PolyA尾配对,可获得最高产量的全长cDNA。
2)原核生物RNA的反转录请选用Random Primers N6或者基因特异性引物。
3)Random Primers N6适用性较广,适用于mRNA、rRNA、tRNA、small RNA和LncRNA等模板。
2,第一链 cDNA 合成操作步骤
1)若实验需要去除残留基因组 DNA
a,gDNA消化
在 RNase-free离心管中配制如下混合液,用移液器轻轻吹打混匀。42℃孵育2 min。
表1 gDNA消化体系*
|
组分 |
使用量 |
|
RNase-free H2O |
To 15 μL |
|
5×gDNA Digester Mix |
3 μL |
|
Total RNA |
10 pg-5 μg* |
|
or mRNA |
10 pg-500 ng* |
*若后续实验为qPCR,Total RNA投入量为10 pg -1 μg;mRNA的投入量为10 pg-100 ng。若基因的表达丰度很低,最多可投入5 ug Total RNA或500 ng mRNA。
b,逆转录反应体系配制(20 μL体系)
表2 逆转录体系(以 20 μL为例)*
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组分 |
使用量 |
|
上一步的反应液 |
15 μL |
|
10×Super Buffer |
2 μL |
|
RT Enzyme Mix |
1 μL |
|
Random Primers N6 (50 μM) |
1 μL |
|
or Oligo (dT)18 (50 μM) or Gene Specific Primer (2 μM) |
or 1 μL |
|
or 1 μL |
|
|
RNase-free H2O |
to 20 μL |
*使用前务必充分混匀,避免剧烈震荡产生过多气泡。
1)逆转录引物:后续进行qPCR时,推荐Random Primers N6与Oligo (dT)18 以1:1混合使用。
2)建议先加入10×Super Buffer 混匀后再添加逆转录引物,以保证完全抑制gDNA digester的活性。
3)体系配制完成后,请用移液器轻轻吹打混匀。
c,逆转录标准程序设置
表3 逆转录标准程序*
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温度 |
时间 |
|
25℃ |
5 min |
|
55℃ |
15 min |
|
85℃ |
5 min |
*标准程序设置建议。
1)逆转录温度:推荐使用55℃。对于高GC含量模板或者复杂模板,可将逆转录温度提高到60℃。
2)逆转录时间:后续进行qPCR时,推荐15 min;若后续用于PCR时,推荐30 min-60 min。
d,逆转录快速程序设置
表4 逆转录快速程序*
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温度 |
时间 |
|
55℃ |
15 min |
|
85℃ |
5 sec |
*逆转录快速程序适用于中低GC含量(≤55%)或者常规模板后续的荧光定量实验。
e,产物保存
逆转录产物可以-20℃短期保存,若需长期保存,建议分装后,于-80℃保存,避免反复冻融。
2)若实验无需去除残留基因组 DNA
a,RNA模板变性
在 RNase-free离心管中配制如下混合液,用移液器轻轻吹打混匀。65℃孵育 5 min,迅速置于冰上,并静置 3 min。
表5 RNA模板变性体系
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组分 |
使用量 |
|
RNase-free H2O |
To 17 μL |
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Total RNA |
10 pg -5 μg |
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or mRNA |
10 pg-500 ng |
|
Random Primers N6 (50 μM) |
1 μL |
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or Oligo (dT)18 (50 μM) or Gene Specific Primer (2 μM) |
or 1 μL |
|
or 1 μL |
b,逆转录反应体系配制(20 μL体系)
表6 逆转录体系(以20 μL为例)*
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组分 |
使用量 |
|
上一步的反应液 |
17 μL |
|
10×Super Buffer |
2 μL |
|
RT Enzyme Mix |
1 μL |
c,逆转录标准程序设置
表7 逆转录标准程序*
|
温度 |
时间 |
|
25℃ |
5 min |
|
55℃ |
15 min |
|
85℃ |
5 min |
*标准程序设置建议。
1)逆转录温度:推荐使用55℃,对于高GC含量模板或者复杂模板,可将逆转录温度提高到60℃。
2)逆转录时间:后续进行qPCR时,推荐 15 min;若后续用于PCR时,推荐30 min-60 min。
d,逆转录快速程序设置
表8 逆转录快速程序*
|
温度 |
时间 |
|
55℃ |
15 min |
|
85℃ |
5 sec |
*逆转录快速程序适用于中低GC含量(≤55%)或者常规模板后续的荧光定量实验。
e,产物保存
逆转录产物可以-20℃短期保存,若需长期保存,建议分装后,于-80℃保存,避免反复冻融。
3)miRNA 第一链 cDNA 茎环法合成操作步骤
a,gDNA消化
在 RNase-free离心管中配制如下混合液,用移液器轻轻吹打混匀。42℃孵育2 min。
表9 gDNA消化体系
|
组分 |
使用量 |
|
RNase-free H2O |
To 15 μL |
|
5×gDNA Digester Mix |
3 μL |
|
Total RNA |
10 pg -5 μg |
b,miRNA逆转录反应体系配制(20 μL体系)
表10 miRNA 逆转录体系(以20 μL为例)*
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组分 |
使用量 |
|
上一步的反应液 |
15 μL |
|
10×Super Buffer |
2 μL |
|
RT Enzyme Mix |
1 μL |
|
Gene Specific Primer (10 μM) |
1 μL |
|
RNase-free H2O |
to 20 μL |
*1)建议先加入10×Super Buffer混匀后再添加逆转录引物,以保证完全抑制gDNA digester的活性。
*2)体系配制完成后,请用移液器轻轻吹打混匀。
c,miRNA 逆转录标准程序设置
表11 miRNA 标准扩增程序*
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温度 |
时间 |
|
25℃ |
5 min |
|
55℃ |
15 min |
|
85℃ |
5 min |
*逆转录时间:后续进行qPCR时,推荐15 min;若后续用于PCR时,推荐30 min-60 min。
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